RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	TAC4	Q86UU9	113 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	BBS10	Q8TAM1	723 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC22A4	Q9H015	551 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CREBZF	Q9NS37	354 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	COL20A1	Q9P218	1284 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PDE10A	Q9Y233	779 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	OR5K3	A6NET4	321 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	KDELR3	O43731	214 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SCGB1D2	O95969	90 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	HTR3A	P46098	478 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PKP4	Q99569	1192 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	HCRTR2	O43614	444 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ATE1	O95260	518 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC34A2	O95436	690 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CD46	P15529	392 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ABO	P16442	354 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TNFRSF4	P43489	277 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC6A8	P48029	635 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NSDHL	Q15738	373 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	LIPJ	Q5W064	366 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	OR52J3	Q8NH60	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MLX	Q9UH92	298 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874		U3KQV3	271 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NTSR1	P30989	418 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	AHSA2	Q719I0	299 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PGAM5	Q96HS1	289 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC22A1	O15245	554 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SNX3	O60493	162 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	UBL4A	P11441	157 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	FMO3	P31513	532 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DIO3	P55073	304 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SLC25A3	Q00325	362 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SCGB2A2	Q13296	93 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TEAD2	Q15562	447 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	REP15	Q6BDI9	236 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CPT1B	Q92523	772 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	NXNL1	Q96CM4	212 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM100	Q9NV29	134 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TAC3	Q9UHF0	121 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	IQCF5	A8MTL0	148 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CCNK	O75909	580 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CBX6	O95503	412 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ITGB5	P18084	799 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PCBD1	P61457	104 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TUBA1B	P68363	451 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	RTL6	Q6ICC9	239 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TUBA1A	Q71U36	451 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	HAS1	Q92839	578 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	TXNDC15	Q96J42	360 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CHD2-208	ENST00000626874	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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