RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626584.2

TCF4-254, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 1,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-254ENST00000626584 MPEG1Q2M385 716 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 LCTLQ6UWM7 567 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ZNF605Q86T29 641 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 P3H2Q8IVL5 708 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 WDR48Q8TAF3 677 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 MAL2Q969L2 176 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TAMM41Q96BW9 452 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 PPCDCQ96CD2 204 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ITPKCQ96DU7 683 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 FEVQ99581 238 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ITPAQ9BY32 194 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ALPK3Q96L96 1907 aa9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 PI15O43692 258 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 PRNPP04156 253 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CD36P16671 472 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 VAMP1P23763 118 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ITGB7P26010 798 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ACADLP28330 430 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CRATP43155 626 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 XCR1P46094 333 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 DGKGP49619 791 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ERVFC1P60507 584 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 VBP1P61758 197 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TUBA1BP68363 451 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CDK6Q00534 326 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 DPTQ07507 201 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ATP1A4Q13733 1029 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 GRIN2CQ14957 1233 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 AHSA2Q719I0 299 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TUBA1AQ71U36 451 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ADCK1Q86TW2 530 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 LGI4Q8N135 537 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SLC5A8Q8N695 610 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 NATD1Q8N6N6 113 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TMIEQ8NEW7 156 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 UBE2FQ969M7 185 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 LGALS12Q96DT0 336 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 KCNC2Q96PR1 638 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 COPS4Q9BT78 406 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 MTG2Q9H4K7 406 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 RMI1Q9H9A7 625 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 RASSF1Q9NS23 344 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 GPR34Q9UPC5 381 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ANGPT4Q9Y264 503 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CLCA1A8K7I4 914 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 M0R082 166 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 KIAA0355O15063 1070 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 VEGFDO43915 354 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SH3BGRLO75368 114 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 CYP17A1P05093 508 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 LCKP06239 509 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 POU2F2P09086 479 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ALOX5P09917 674 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 BMP4P12644 408 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 UQCRC2P22695 453 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ITGB8P26012 769 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 AQP1P29972 269 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 PSMD7P51665 324 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 ST8SIA6P61647 398 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 SPIBQ01892 262 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 IRF3Q14653 427 aa9.59□□□□□ -0.87
TCF4-254ENST00000626584 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms