RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NEMP2	A6NFY4	417 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BM21	787 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	UGT2B11	O75310	529 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNH1	O95259	989 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SNAP29	O95721	258 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CEACAM5	P06731	702 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RALB	P11234	206 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PSKH1	P11801	424 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	COX4I1	P13073	169 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PDHA2	P29803	388 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXA6	P31267	233 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR3A	P46098	478 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SEPHS1	P49903	392 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CCR5	P51681	352 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PEX6	Q13608	980 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPK11	Q15759	364 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NEDD8	Q15843	81 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PCID2	Q5JVF3	399 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KCTD11	Q693B1	232 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GUSBP11	Q6P575	273 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF534	Q76KX8	674 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PIM3	Q86V86	326 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKFN1	Q8N957	763 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	POC5	Q8NA72	575 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	OR8K3	Q8NH51	312 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP76	Q8TAP6	659 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SNAPC3	Q92966	411 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF170	Q96K19	258 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DACH2	Q96NX9	599 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	IL22	Q9GZX6	179 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	POLE4	Q9NR33	117 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PCM1	Q15154	2024 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PRG6	482 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PLOD2	O00469	737 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN4	O14817	238 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SOD1	P00441	154 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KEL	P23276	732 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	UQCRC1	P31930	480 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGDIA	P52565	204 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNJ11	Q14654	390 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGG	Q5H8A4	983 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PPM1J	Q5JR12	505 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DESI1	Q6ICB0	168 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NOXA1	Q86UR1	476 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNMB4	Q86W47	210 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM129C	Q86XR2	697 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TAGAP	Q8N103	731 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	EID3	Q8N140	333 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SVOP	Q8N4V2	548 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC9A6	Q92581	669 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TESC	Q96BS2	214 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	C12orf66	Q96MD2	445 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2M4	Q96R27	311 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PAFAH2	Q99487	392 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GHITM	Q9H3K2	345 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPN10	Q9HC96	672 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ASF1A	Q9Y294	204 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	AUP1	Q9Y679	476 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RP1	P56715	2156 aa		6.95	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PR77	199 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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