RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	CDH16	O75309	829 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CLDN9	O95484	217 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ALPP	P05187	535 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PHEX	P78562	749 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CDK15	Q96Q40	435 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	MS4A8	Q9BY19	250 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	LANCL2	Q9NS86	450 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		21.32	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM227A	F5H4B4	570 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC28A2	O43868	658 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	GLRA3	O75311	464 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	MTTP	P55157	894 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RHAG	Q02094	409 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RUNX2	Q13950	521 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RASA2	Q15283	850 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	NSDHL	Q15738	373 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CAVIN3	Q969G5	261 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	QRFPR	Q96P65	431 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SERINC2	Q96SA4	455 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	LHPP	Q9H008	270 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		21.31	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968		H0YIV9	168 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SUV39H1	O43463	412 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	DLX3	O60479	287 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	NUDT17	P0C025	328 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PIK3CB	P42338	1070 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CDH13	P55290	713 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968		Q0VFX4	171 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PCOLCE	Q15113	449 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	COLEC12	Q5KU26	742 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RNF175	Q8N4F7	328 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	KCNC2	Q96PR1	638 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	NTMT1	Q9BV86	223 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	OR51B5	Q9H339	312 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	C5AR2	Q9P296	337 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ATM	Q13315	3056 aa		21.3	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SCN2A	Q99250	2005 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	PRMT3	O60678	531 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	DPM1	O60762	260 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SUPT7L	O94864	414 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CERS1	P27544	350 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CCT5	P48643	541 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	RAP1GDS1	P52306	607 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	HERVK_113	P63132	956 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	BTG2	P78543	158 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	HPS6	Q86YV9	775 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	TSLP	Q969D9	159 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	AGAP4	Q96P64	663 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	CENPK	Q9BS16	269 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		21.29	■■□□□ 1
TIMM44-208	ENST00000598968		A0A1W2PQ72	361 aa		21.28	■■□□□ 1

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