RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597423.1

TRIM28-209, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

TSL 3

Gene TRIM28, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-209ENST00000597423 RTKNQ9BST9 563 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PARD6AQ9NPB6 346 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MYNNQ9NPC7 610 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 HYKKA2RU49 373 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 B2RBV5 119 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NR5A2O00482 541 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ANKRD28O15084 1053 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 OR2B3O76000 313 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 STATHP02808 62 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 KRT16P08779 473 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 T-ENOLP0DO92 83 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 DRD2P14416 443 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TACR1P25103 407 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TAS2R50P59544 299 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FAM53BQ14153 422 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MUM1Q2TAK8 710 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PHF19Q5T6S3 580 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CPTPQ5TA50 214 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 STPG1Q5TH74 334 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CLMPQ9H6B4 373 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 REEP4Q9H6H4 257 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RMND5AQ9H871 391 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 WDR41Q9HAD4 459 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GID8Q9NWU2 228 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PHF11Q9UIL8 331 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PSME2Q9UL46 239 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 A0A0A6YYD5 115 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FITM1A5D6W6 292 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 AIM2O14862 343 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GYG2O15488 501 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 P2RX6O15547 441 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 AKAP10O43572 662 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CBFA2T3O75081 653 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 SCELO95171 688 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 NPPAP01160 153 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GBAP04062 536 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 COX7A2P14406 83 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PTPN4P29074 926 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 AVPR1BP47901 424 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GABRA4P48169 554 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ARSFP54793 590 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ITGA1P56199 1179 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RCAN2Q14206 197 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 HKDC1Q2TB90 917 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PGS1Q32NB8 556 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 DEFB134Q4QY38 66 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GK5Q6ZS86 529 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 GPR180Q86V85 440 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 C1orf21Q9H246 121 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 LYRM4Q9HD34 91 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 CACNA1HO95180 2353 aa14.48□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 D6RAR5 112 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 RFPL3O75679 317 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 LRATO95237 230 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 PGRP06401 933 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 FOLR1P15328 257 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 TGM1P22735 817 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 KIR3DL1P43629 444 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 KLC1Q07866 573 aa14.47□□□□□ -0.09
TRIM28-209ENST00000597423 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms