RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA10O75578 1167 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCN2P51788 898 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TFF3Q07654 80 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS11BQ86T26 416 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 UCK2Q9BZX2 261 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PELI2Q9HAT8 420 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW2Q9UKT8 454 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF6Q9Y252 685 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 URADA6NGE7 173 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE9AO76083 593 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 HECTD2Q5U5R9 776 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SBSNQ6UWP8 590 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0408Q6ZU52 694 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM156Q8N614 296 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 GPATCH11Q8N954 259 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPV3Q8NET8 790 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CREB3L4Q8TEY5 395 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 DYRK1BQ9Y463 629 aa23.9■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF3C1Q12789 2109 aa23.89■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R1BP30154 601 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNB4P30926 498 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MSS51Q4VC12 460 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SPANXN3Q5MJ09 141 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM211Q6ICI0 200 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 NXPE4Q6UWF7 544 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRB4Q8NHJ6 448 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB5Q8WWX0 329 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 CERS2Q96G23 380 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 AIF1LQ9BQI0 150 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 DEPPQ9NTK1 212 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN16Q9Y5I7 305 aa23.89■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFBR3LH3BV60 316 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 NRDCO43847 1150 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TOXO94900 526 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC4O95801 387 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA6P08185 405 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TERF2Q15554 542 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R3AQ16821 1122 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC4Q5J8M3 183 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT7Q86SF2 657 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SCUBE1Q8IWY4 988 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 NCLNQ969V3 563 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 VMP1Q96GC9 406 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 KCMF1Q9P0J7 381 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A14Q9Y267 594 aa23.88■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PINLYPA6NC86 204 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR143P51810 404 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 BTN3A2P78410 334 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 RUNX2Q13950 521 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM52Q8NDY8 209 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 RND1Q92730 232 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB127Q9H1M4 99 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA7Q9Y334 891 aa23.87■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JN53 185 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 USP27XA6NNY8 438 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB4AP04350 444 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MSX1P28360 303 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SSR4P51571 173 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PSD4Q8NDX1 1056 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PBKQ96KB5 322 aa23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM200CA6NKL6 621 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP107P57740 925 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 XKR6Q5GH73 641 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 GAL3ST3Q96A11 431 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ16Q9NPI9 418 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-11Q9UQG0 969 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNE2Q9Y6J6 123 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MED13LQ71F56 2210 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JMM0 328 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPB8 328 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms