RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	NME4	O00746	187 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	NDUFB5	O43674	189 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ACTR1B	P42025	376 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ACTR1A	P61163	376 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FOXM1	Q08050	763 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	LAPTM5	Q13571	262 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	NFYC	Q13952	458 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SPATS1	Q496A3	300 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HID1	Q8IV36	788 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PJA1	Q8NG27	643 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TSSK3	Q96PN8	268 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	EBPL	Q9BY08	206 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PELI2	Q9HAT8	420 aa		14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TNFRSF10A	O00220	468 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SOCS2	O14508	198 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CLOCK	O15516	846 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SH3BGRL	O75368	114 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IL10	P22301	178 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPK1	P28482	360 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	NUDT1	P36639	197 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPG	P40121	348 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PHC1	P78364	1004 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CDC20	Q12834	499 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FZD2	Q14332	565 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	C6orf183	Q5T699	404 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DHFR2	Q86XF0	187 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CMTM6	Q9NX76	183 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PPT2	Q9UMR5	302 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	VCAN	P13611	3396 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	USP34	Q70CQ2	3546 aa		14.73	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KNL1	Q8NG31	2342 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RASAL1	O95294	804 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PGR	P06401	933 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	THEGL	P0DJG4	465 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TGM1	P22735	817 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PIK3CB	P42338	1070 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT33B	Q14525	404 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	BROX	Q5VW32	411 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SPRED1	Q7Z699	444 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PARP8	Q8N3A8	854 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC6A18	Q96N87	628 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ZBTB18	Q99592	522 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318		H0YAE9	185 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MYO1D	O94832	1006 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	NPPA	P01160	153 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IL6	P05231	212 aa		14.72	□□□□□ -0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	F3	P13726	295 aa		14.72	□□□□□ -0.05

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