RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 VMP1Q96GC9 406 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A0G2JMM0 328 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PPB8 328 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PRS3 328 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 KIR3DP1A8MWS1 328 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SYT5O00445 386 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 AVILO75366 819 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 OR2J2O76002 312 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 BMP5P22003 454 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 TACR1P25103 407 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 HNF4AP41235 474 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 NPY2RP49146 381 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CLCN7P51798 805 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM251Q8N6I4 163 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA3Q8NHX4 192 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 NCLNQ969V3 563 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFATQ9P243 1243 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CTAGE9A4FU28 777 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 HSPB2A8KAH6 182 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 GFYI3L273 518 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 AQP7O14520 342 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 DVL2O14641 736 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFAND5O76080 213 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 MGAT1P26572 445 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ARNTP27540 789 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 DCAF7P61962 342 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 NAE1Q13564 534 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SNX1Q13596 522 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC10A1Q14973 349 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 HSPB2Q16082 182 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PAK5Q9P286 719 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 TUBAL3A6NHL2 446 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 LIASO43766 372 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 OR6B1O95007 311 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 IGHG3P01860 377 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 GABRA1P14867 456 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ASCL1P50553 236 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CCR8P51685 355 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB8AP61006 207 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP2R2BQ00005 443 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PWP1Q13610 501 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SHEQ5VZ18 495 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 SYBUQ9NX95 663 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 MPDZO75970 2070 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1B0GVC2 190 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 AP3B1O00203 1094 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 WWP2O00308 870 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF9O43307 516 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CELA3AP09093 270 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CNR1P21554 472 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SOX3P41225 446 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 PALM2Q8IXS6 379 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 VWA5B2Q8N398 1253 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SUSD5O60279 629 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 GLSO94925 669 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 PAMP19021 973 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 CCND1P24385 295 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 BMPR2Q13873 1038 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-205ENST00000588780 PHKG1Q16816 387 aa20.19■□□□□ 0.82
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