RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 GBAP04062 536 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 PRPS2P11908 318 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 ACPPP15309 386 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 TACR1P25103 407 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 BSGP35613 385 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 ARSFP54793 590 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 EMP3P54852 163 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 GALNT18Q6P9A2 607 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 SIRT5Q9NXA8 310 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 MCM8Q9UJA3 840 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 EEDO75530 441 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 MED26O95402 600 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 IL1RNP18510 177 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 MAPK12P53778 367 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 MTTPP55157 894 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 RAB11FIP2Q7L804 512 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 LIX1Q8N485 282 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 CDC26Q8NHZ8 85 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 CUTCQ9NTM9 273 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 SEC16AO15027 2179 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 B3GALT2O43825 422 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 SDC1P18827 310 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF763Q0D2J5 394 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 ACOT4Q8N9L9 421 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 SMIM10Q96HG1 83 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 CERS1P27544 350 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 AVPR1BP47901 424 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 SQLEQ14534 574 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 PTGR1Q14914 329 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 PRSS41Q7RTY9 318 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 MIER2Q8N344 545 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 C10orf90Q96M02 699 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 SLC39A1Q9NY26 324 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 CCL4P13236 92 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 TSPAN7P41732 249 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTN4-210ENST00000588618 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTN4-210ENST00000588618 ENAMQ9NRM1 1142 aa21.46■■□□□ 1.03
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