RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 C14orf80Q86SX3 495 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 OSTF1Q92882 214 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC120Q96HB5 630 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 CLCN2P51788 898 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 REEP3Q6NUK4 255 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF675Q8TD23 568 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 NR4A3Q92570 626 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.61■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 MAP2K4P45985 399 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.61■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 IL7P13232 177 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 CD1DP15813 335 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF45Q02386 682 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 SPATC1Q76KD6 591 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 GDI1P31150 447 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 FANK1Q8TC84 345 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 SEC23BQ15437 767 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 MOGSQ13724 837 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 DECR1Q16698 335 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRM-211ENST00000580170 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 FAM72CH0Y354 149 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 TYRP14679 529 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRM-211ENST00000580170 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.59■□□□□ 0.89
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