RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF273Q14593 569 aa2.93□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 DUSP22Q9NRW4 184 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RNF146Q9NTX7 359 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa2.93□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC12Q9UKB3 198 aa2.93□□□□□ -1.94
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