RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINB5P36952 375 aa31.34■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CUL3Q13618 768 aa31.34■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYT16Q17RD7 645 aa31.34■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6Y1Q8NGX8 325 aa31.34■■■□□ 2.61
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51Q1Q8NH59 317 aa31.34■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VWA2Q5GFL6 755 aa31.33■■■□□ 2.61
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CTDNEP1-209ENST00000574205 QRFPRQ96P65 431 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNA7Q96RP8 456 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM22Q9Y584 194 aa31.32■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRCPO75575 148 aa31.31■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SERINC2Q96SA4 455 aa31.31■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 B3GALT2O43825 422 aa31.3■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNGP07510 517 aa31.3■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 XCR1P46094 333 aa31.3■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OLR1P78380 273 aa31.3■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL10RAQ13651 578 aa31.3■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERV3-1Q14264 604 aa31.3■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CHST10O43529 356 aa31.29■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SSPNQ14714 243 aa31.29■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AP5B1Q2VPB7 878 aa31.29■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MGARPQ8TDB4 240 aa31.29■■■□□ 2.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RTCAO00442 366 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCELO95171 688 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 UMODP07911 640 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 UROSP10746 265 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEFHP12036 1026 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSR2P43308 183 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC20Q12834 499 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
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