RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 MARVELD3Q96A59 401 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ESAMQ96AP7 390 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC39Q96DD0 335 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC120Q96HB5 630 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS39Q96JC1 886 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGED4Q96JG8 741 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AICDAQ9GZX7 198 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPAMQ9HCL2 828 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMP25Q9NPA2 562 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 WWOXQ9NZC7 414 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITPR2Q14571 2701 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLGNO14967 610 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TP73O15350 636 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRMT3O60678 531 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC19A2O60779 497 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH3BGRLO75368 114 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A12O75746 678 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYC1P08574 325 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYBL2P10244 700 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD46P15529 392 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CERS1P27544 350 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP2R1BP30154 601 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SSTR1P30872 391 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AHRP35869 848 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTN3A2P78410 334 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBPJQ06330 500 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 EMBQ6PCB8 327 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC25Q86WR0 208 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFT20Q8IY31 132 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CA13Q8N1Q1 262 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRPV3Q8NET8 790 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RELTQ969Z4 430 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAR2Q96K12 515 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FRMD6Q96NE9 622 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RHOJQ9H4E5 214 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRFN1Q9P244 771 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 OARD1Q9Y530 152 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.72□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CREBBPQ92793 2442 aa6.71□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 URADA6NGE7 173 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 E7ESA3 106 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC188H7C350 402 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD51CO43502 376 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEURL1O76050 574 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYO1DO94832 1006 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SP1P08047 785 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINA6P08185 405 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC166P0CW27 439 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABOP16442 354 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF24P17028 368 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL10P22301 178 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CA7P43166 264 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPA7P48741 367 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLA2G16P53816 162 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASP6P55212 293 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR85P60893 370 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALCOCO2Q13137 446 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC13A2Q13183 592 aa6.71□□□□□ -1.34
CCNDBP1-212ENST00000567690 RUNX2Q13950 521 aa6.71□□□□□ -1.34
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