RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 SFT2D3Q587I9 215 aa20.08■□□□□ 0.81
RNPS1-218ENST00000566180 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.08■□□□□ 0.81
RNPS1-218ENST00000566180 LAS2Q8IYD9 372 aa20.08■□□□□ 0.81
RNPS1-218ENST00000566180 GALNT11Q8NCW6 608 aa20.08■□□□□ 0.81
RNPS1-218ENST00000566180 UBE2E3Q969T4 207 aa20.08■□□□□ 0.81
RNPS1-218ENST00000566180 L2HGDHQ9H9P8 463 aa20.08■□□□□ 0.81
RNPS1-218ENST00000566180 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RNPS1-218ENST00000566180 A0A088AWK7 358 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 A0A0G2JN53 185 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 FAM227AF5H4B4 570 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PRMT3O60678 531 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 VPS4BO75351 444 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PLA2G16P53816 162 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 BTG2P78543 158 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 LGSNQ5TDP6 509 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MED27Q6P2C8 311 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ABHD17CQ6PCB6 329 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 LPAR4Q99677 370 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 VPS4AQ9UN37 437 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.07■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 B3GALT2O43825 422 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 GCAP28676 217 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 OR4D2P58180 307 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TLR1Q15399 786 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 EXT1Q16394 746 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 OR7G3Q8NG95 312 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 M1APQ8TC57 530 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 F2RL3Q96RI0 385 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SERINC2Q96SA4 455 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MS4A8Q9BY19 250 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PRDM7Q9NQW5 492 aa20.06■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SERPINB1P30740 379 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MTTPP55157 894 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TGM3Q08188 693 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 LIPJQ5W064 366 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 HAS2Q92819 552 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 C19orf60Q96EN9 201 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CNDP1Q96KN2 507 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MMP25Q9NPA2 562 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TMCO1Q9UM00 188 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 NUP210LQ5VU65 1888 aa20.05■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 DYTNA2CJ06 578 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 E2F3O00716 465 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 UQCRHP07919 91 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PCNAP12004 261 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MAOAP21397 527 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TSFMP43897 325 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PIK3CGP48736 1102 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 RAB38P57729 211 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ARG2P78540 354 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 GTF2H2Q13888 395 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SLC29A2Q14542 456 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 CHSY3Q70JA7 882 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 MTBPQ96DY7 904 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 SCYL1Q96KG9 808 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 KCNC2Q96PR1 638 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 RNF32Q9H0A6 362 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 IPPKQ9H8X2 491 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 ACTR8Q9H981 624 aa20.04■□□□□ 0.8
RNPS1-218ENST00000566180 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms