RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564228.5

TCF4-222, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-222	ENST00000564228	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PGBD3	Q8N328	593 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GGH	Q92820	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PLD2	O14939	933 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PRAMEF11	O60813	436 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ECI2	O75521	394 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SEMG1	P04279	462 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HLA-DQB2	P05538	268 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ALAS2	P22557	587 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GGT2	P36268	569 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RENBP	P51606	427 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	WNT3A	P56704	352 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ACVR1	Q04771	509 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ITK	Q08881	620 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GTF2H3	Q13889	308 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GPR19	Q15760	415 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MPP7	Q5T2T1	576 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MARC1	Q5VT66	337 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	NETO1	Q8TDF5	533 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	IRF7	Q92985	503 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MYADM	Q96S97	322 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	NT5M	Q9NPB1	228 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	IL20	Q9NYY1	176 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228		E5RI56	91 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	WNT9A	O14904	365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	KDELR3	O43731	214 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SLC22A5	O76082	557 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	EPN2	O95208	641 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CCNDBP1	O95273	360 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PEX11B	O96011	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PTH	P01270	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	IL6	P05231	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TYR	P14679	529 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	WEE1	P30291	646 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MAX	P61244	160 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	LMAN2	Q12907	356 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ZNF235	Q14590	738 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	LINGO4	Q6UY18	593 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ATCAY	Q86WG3	371 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	APCDD1	Q8J025	514 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	COQ8B	Q96D53	544 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OTUB2	Q96DC9	234 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ASIC4	Q96FT7	647 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	MYO10	Q9HD67	2058 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	OR4F21	O95013	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TCF4-222	ENST00000564228	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71

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