RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 KPNA5O15131 536 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FFAR2O15552 330 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GRID2O43424 1007 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 LATO43561 262 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 VEGFDO43915 354 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRAMEF10O60809 474 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DIAPH2O60879 1101 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CRCPO75575 148 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRKD3O94806 890 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA0754O94854 1291 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 C8GP07360 202 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MPC1LP0DKB6 136 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACP5P13686 325 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 VCLP18206 1134 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP2A7P20853 494 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDHA2P29803 388 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 AKT2P31751 481 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GRIA3P42263 894 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GNPDA1P46926 289 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSPA7P48741 367 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 STARD6P59095 220 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTXN1P60606 82 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 HERVK_113P63132 956 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRKAA1Q13131 559 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFE2L1Q14494 772 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TGFBIQ15582 683 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHKG1Q16816 387 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CUZD1Q86UP6 607 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 LSMEM2Q8N112 164 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FRMD1Q8N878 549 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DPF1Q92782 380 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM131CQ96AQ9 280 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNDP1Q96KN2 507 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RILPQ96NA2 401 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 EBF4Q9BQW3 602 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOOQ9BUR5 198 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR174Q9BXC1 333 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERVK-6Q9BXR3 956 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 COG4Q9H9E3 785 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SGK2Q9HBY8 427 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL15Q9NXU5 204 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 HEY2Q9UBP5 337 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 WNT16Q9UBV4 365 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMCO1Q9UM00 188 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDYLQ9Y232 598 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 FANCMQ8IYD8 2048 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC189A1A4V9 331 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 POM121BA6NF01 834 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCT8L1PA6NM43 557 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGEF33A8MVX0 844 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP6CO00743 305 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 STX16O14662 325 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 KMOO15229 486 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAPBPO15533 448 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 NDUFS2O75306 463 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 KATNA1O75449 491 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPC4O75487 556 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 DCTN3O75935 186 aa5.28□□□□□ -1.56
USP3-AS1-202ENST00000559357 TGDSO95455 350 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms