RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CPZQ66K79 652 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM205Q6UW68 189 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC63Q8NA47 563 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RGMAQ96B86 450 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PEX11GQ96HA9 241 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MS4A8Q9BY19 250 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LHPPQ9H008 270 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 AHSPQ9NZD4 102 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SNX6Q9UNH7 406 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ASB1Q9Y576 335 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MED13Q9UHV7 2174 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 B8ZZF3 427 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA8RI6L899 631 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRMT3O60678 531 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SUPT7LO94864 414 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 UQCRHP07919 91 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT4P19013 534 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CD22P20273 847 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 IMPDH1P20839 514 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PLA2G16P53816 162 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB38P57729 211 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF33BQ06732 778 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NFATC3Q12968 1075 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 BIKQ13323 160 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CUL3Q13618 768 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SYT16Q17RD7 645 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TEX19Q8NA77 164 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINI1Q99574 410 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LYRM4Q9HD34 91 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MKS1Q9NXB0 559 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ATRXP46100 2492 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KALRNO60229 2985 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 SEMA3DO95025 777 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 MYZAPP0CAP1 466 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 SSR2P43308 183 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 PRKAA2P54646 552 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 PKNOX1P55347 436 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 HSD17B7P56937 341 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 CHAF1BQ13112 559 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 NSDHLQ15738 373 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 EXT1Q16394 746 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 FRG2Q64ET8 278 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 AGAP4Q96P64 663 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 FRG2BQ96QU4 278 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 SMC6Q96SB8 1091 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 LPAR4Q99677 370 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 KLHL31Q9H511 634 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-205ENST00000558534 PHF11Q9UIL8 331 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms