RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556765.1

TRAPPC6B-206, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, human

TSL 3

Gene TRAPPC6B, Length 664 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	STMND1	H3BQB6	276 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	NR5A2	O00482	541 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	DNAJA2	O60884	412 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	STAMBP	O95630	424 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	IL6	P05231	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ANXA6	P08133	673 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ASMT	P46597	345 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	DIO3	P55073	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	C21orf58	P58505	322 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ACTR3	P61158	418 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ABAT	P80404	500 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	C1orf61	Q13536	156 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	DPP10	Q8N608	796 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TTL	Q8NG68	377 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	OR4K3	Q96R72	315 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	DPY30	Q9C005	99 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	RASGRP1	O95267	797 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	FKBP9	O95302	570 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	DDAH2	O95865	285 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TNF	P01375	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	LIF	P15018	202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ME2	P23368	584 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PKLR	P30613	574 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SHMT2	P34897	504 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	GSTM5	P46439	218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	CLDN8	P56748	225 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PSME3	P61289	254 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	NKD1	Q969G9	470 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TESC	Q96BS2	214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	CMKLR1	Q99788	373 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	FBP2	O00757	339 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	ANKRD28	O15084	1053 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	YY2	O15391	372 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	CLDN1	O95832	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	FUCA1	P04066	466 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	G6PD	P11413	515 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	AMD1	P17707	334 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	CD22	P20273	847 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	CCR8	P51685	355 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRAPPC6B-206	ENST00000556765	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23

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