RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 C4orf17Q53FE4 359 aa22.95■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.95■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.95■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 NR4A3Q92570 626 aa22.95■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF592Q92610 1267 aa22.95■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.95■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.95■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 A8MUA0 341 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 B3GALT2O43825 422 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 CLEC3AO75596 197 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 LDLRP01130 860 aa22.94■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 GUCY2DQ02846 1103 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 LAPTM5Q13571 262 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 DOC2AQ14183 400 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.94■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.94■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 PHBP35232 272 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 PER3P56645 1201 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 TGM3Q08188 693 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 CHIT1Q13231 466 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 TUBA3CQ13748 450 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 CD244Q9BZW8 370 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.93■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 COPG2Q9UBF2 871 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 ACOT9Q9Y305 439 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.93■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22.92■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 LRRTM2O43300 516 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 SLC13A2Q13183 592 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 OR1C1Q15619 314 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 MROH9Q5TGP6 573 aa22.92■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 OPTCQ9UBM4 332 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 MMACHCQ9Y4U1 282 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 SVILO95425 2214 aa22.92■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 A0A087X1B8 175 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 UBXN8O00124 270 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 MAN1A2O60476 641 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 KERAO60938 352 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 CD46P15529 392 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 CD96P40200 585 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 RAB38P57729 211 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 KCNK10P57789 538 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.91■■□□□ 1.26
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PRKCH-216ENST00000555542 FAM47BQ8NA70 645 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 ELP5Q8TE02 316 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 NXNL1Q96CM4 212 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 NPAS2Q99743 824 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.91■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 SYCE1LA8MT33 242 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 PRAMEF4O60810 478 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 PCNAP12004 261 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 MSH2P43246 934 aa22.9■■□□□ 1.26
PRKCH-216ENST00000555542 KCNC1P48547 511 aa22.9■■□□□ 1.26
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