RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 OR4D1Q15615 310 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZNF766Q5HY98 468 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SPINK14Q6IE38 97 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 C8orf74Q6P047 294 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GFRALQ6UXV0 394 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CA13Q8N1Q1 262 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SLC5A8Q8N695 610 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZNF592Q92610 1267 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KIAA1191Q96A73 305 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TAAR6Q96RI8 345 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ALG9Q9H6U8 611 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NMRAL1Q9HBL8 299 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KLHL1Q9NR64 748 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GUH1 482 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ESYT3A0FGR9 886 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 B3GALT2O43825 422 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MAN1A2O60476 641 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SUPT3HO75486 399 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CLEC3AO75596 197 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TFEBP19484 476 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 COL8A1P27658 744 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GSTM2P28161 218 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CRABP2P29373 138 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GMPRP36959 345 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KCNC1P48547 511 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KCNK10P57789 538 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 IRF8Q02556 426 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GUCY2DQ02846 1103 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TGM3Q08188 693 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SLC13A2Q13183 592 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CHIT1Q13231 466 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 LAPTM5Q13571 262 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TUBA3CQ13748 450 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 RUNX2Q13950 521 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 DOC2AQ14183 400 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 OR1C1Q15619 314 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 INAQ16352 499 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PDK4Q16654 411 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MROH9Q5TGP6 573 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ISCA2Q86U28 154 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 FJX1Q86VR8 437 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NR4A3Q92570 626 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 CD244Q9BZW8 370 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NT5DC2Q9H857 520 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 LRFN1Q9P244 771 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 ACOT9Q9Y305 439 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 GABRR3A8MPY1 467 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 UBXN8O00124 270 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 FCHO1O14526 889 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 SH3BGRLO75368 114 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-222ENST00000540445 MYO1DO94832 1006 aa8.44□□□□□ -1.06
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