RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KRT39	Q6A163	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FZD8	Q9H461	694 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LCT	P09848	1927 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MAGEB2	O15479	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CLDN3	O15551	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FAM189A1	O60320	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CIDEA	O60543	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MOCS3	O95396	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GH1	P01241	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NR1D1	P20393	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DCT	P40126	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ACOT2	P49753	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MFAP3	P55082	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CDH11	P55287	796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PTEN	P60484	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	HYAL1	Q12794	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908		Q6ZTC4	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SHC3	Q92529	594 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	TOM1L1	O75674	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	C22orf31	O95567	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	LGALS2	P05162	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	EDN1	P05305	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS13-208	ENST00000531908	ACP2	P11117	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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