RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 QRFPRQ96P65 431 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 APOL5Q9BWW9 433 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 BEX2Q9BXY8 128 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CIPCQ9C0C6 399 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 GLS2Q9UI32 602 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PPT2Q9UMR5 302 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 U3KQ87 197 aa7.24□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PLXNA3P51805 1871 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A0B4J293 547 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC12A8A0AV02 714 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 F5H5T6 163 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 I3L521 148 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 M0QZ92 97 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PRKYO43930 277 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PEX10O60683 326 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 AP2A2O94973 939 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 APBA3O96018 575 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CSF2P04141 144 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 TPOP07202 933 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 OR56A5P0C7T3 313 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 NR2F6P10588 404 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 HK1P19367 917 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ITGALP20701 1170 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CBLP22681 906 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 GSTM5P46439 218 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 BRCC3P46736 316 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 HSF2Q03933 536 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC14A1Q13336 389 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ILKQ13418 452 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAM15Q13444 863 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 TP53BP2Q13625 1128 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNC3Q14003 757 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ARHGEF7Q14155 803 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 MBTPS1Q14703 1052 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 RGNQ15493 299 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 GRK1Q15835 563 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 OCLNQ16625 522 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 UPP1Q16831 310 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PLK5Q496M5 336 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PHC2Q8IXK0 858 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 OR8K5Q8NH50 307 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF31Q96EP0 1072 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CHFRQ96EP1 664 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM129BQ96TA1 746 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 NELL2Q99435 816 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 DUSP26Q9BV47 211 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 MED28Q9H204 178 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CHST8Q9H2A9 424 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 MCUBQ9NWR8 336 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 IL20Q9NYY1 176 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 FKBP7Q9Y680 259 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.23□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.22□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A1B0GVI7 797 aa7.22□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PIPSLA2A3N6 862 aa7.22□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 H3BM21 787 aa7.22□□□□□ -1.25
HMBOX1-211ENST00000524238 PDHXO00330 501 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms