RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	NPAS2	Q99743	824 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SUFU	Q9UMX1	484 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC154	A6NI56	674 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131		A8MUI8	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131		E7EQ34	232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PSMG1	O95456	288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	G6PD	P11413	515 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	LIF	P15018	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CAPN3	P20807	821 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HRH2	P25021	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	GSTM2	P28161	218 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CSF2RB	P32927	897 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CASR	P41180	1078 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ASMT	P46597	345 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	KIAA0040	Q15053	153 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SPIN4	Q56A73	249 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TESC	Q96BS2	214 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CDRT15	Q96T59	188 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	DPY30	Q9C005	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	POMP	Q9Y244	141 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ENTPD5	O75356	428 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CCNDBP1	O95273	360 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	STAMBP	O95630	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	FUCA1	P04066	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	BCKDHA	P12694	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HSD17B1	P14061	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AMD1	P17707	334 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CD22	P20273	847 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CD1C	P29017	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PKLR	P30613	574 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	RAB28	P51157	221 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR1D5	P58170	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	UFM1	P61960	85 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AP2B1	P63010	937 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ABAT	P80404	500 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	BNIP2	Q12982	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TLR1	Q15399	786 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	LIX1	Q8N485	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OR7G3	Q8NG95	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	PATE1	Q8WXA2	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	LRRC58	Q96CX6	371 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	TAAR9	Q96RI9	348 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	ACTL8	Q9H568	366 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MEG3-223	ENST00000524131	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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