RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	AK1	P00568	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KLKB1	P03952	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HOXA5	P20719	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AGA	P20933	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MAL	P21145	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FPR1	P21462	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AHCY	P23526	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PBX1	P40424	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPZA1	P52907	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TAS2R38	P59533	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	STX1B	P61266	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MYL7	Q01449	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LIPE	Q05469	1076 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXL1	Q12952	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBB3	Q13509	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C1orf61	Q13536	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CRYM	Q14894	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT31	Q15323	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SPA17	Q15506	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ART4	Q93070	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ART5	Q96L15	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TSG101	Q99816	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB20	Q9NX57	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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