RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 ACVR1Q04771 509 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 PHKG1Q16816 387 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 C17orf64Q86WR6 236 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 LIX1Q8N485 282 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 KIAA1191Q96A73 305 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 PERPQ96FX8 193 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 VMP1Q96GC9 406 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.87□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 HAX1O00165 279 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 WWP2O00308 870 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 NDUFS4O43181 175 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ALOX12P18054 663 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 SOX3P41225 446 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 DNASE1L1P49184 302 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 BMPR2Q13873 1038 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 RTL4Q6ZR62 310 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ABHD13Q7L211 337 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 MPP5Q8N3R9 675 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 NCLNQ969V3 563 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CHP1Q99653 195 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 PIP5K1AQ99755 562 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ZFATQ9P243 1243 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 INTUQ9ULD6 942 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 AHRRA9YTQ3 701 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 OR1F1O43749 312 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CEP104O60308 925 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 EPPINO95925 133 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 B3GALT4O96024 378 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TPM3P06753 285 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TPM1P09493 284 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 HNF4AP41235 474 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 SORDQ00796 357 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 RGS1Q08116 209 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 KCNJ11Q14654 390 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 IQCB1Q15051 598 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TCEAL1Q15170 157 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.836e-7■■□□□ 11.6
COPB2-208ENST00000512153 XKR6Q5GH73 641 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 NAXEQ8NCW5 288 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 PEX13Q92968 403 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 DACH2Q96NX9 599 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 BIRC8Q96P09 236 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CCL19Q99731 98 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 MYOTQ9UBF9 498 aa9.85□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 URADA6NGE7 173 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CLDN4O14493 209 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 ESR1P03372 595 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 IFNA16P05015 189 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 FPR1P21462 350 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 IMPA1P29218 277 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 GRIA1P42261 906 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 CPA2P48052 419 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 TRPC1P48995 793 aa9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
COPB2-208ENST00000512153 WNT3P56703 355 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms