RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL26Q9Y258 94 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 A8MVJ9 347 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CDK6Q00534 326 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PRKCDQ05655 676 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 E2F2Q14209 437 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CARTPTQ16568 116 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF130Q86XS8 419 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5AK3PQ8NH89 298 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 Q96MT0 163 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 EHD1Q9H4M9 534 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 LEFTY1O75610 366 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 DLGAP3O95886 979 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 IRF3Q14653 427 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 MPEG1Q2M385 716 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CRELD1Q96HD1 420 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 FOPNLQ96NB1 174 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R16Q9NYV7 291 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 KLK4Q9Y5K2 254 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 OBSL1O75147 1896 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF10O60809 474 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNK2O95069 426 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TGFB1P01137 390 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 FURINP09958 794 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC80Q76M96 950 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 NLRP8Q86W28 1048 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 SYTL1Q8IYJ3 562 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF480Q8WV37 535 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 REPS1Q96D71 796 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PIP5K1AQ99755 562 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM39Q9HCM9 518 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 WASH3PC4AMC7 463 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PLK4O00444 970 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 NPPBP16860 134 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGP20916 626 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 XCR1P46094 333 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 HMGA2P52926 109 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GANABQ14697 944 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CRB2Q5IJ48 1285 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 IER5LQ5T953 404 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 HEATR4Q86WZ0 1026 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 OXR1Q8N573 874 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 SCAIQ8N9R8 606 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PPCDCQ96CD2 204 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM129BQ96TA1 746 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 SPG21Q9NZD8 308 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR37L1O60883 481 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 DNTTP04053 509 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 UGT2B15P54855 530 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 C2orf80Q0P641 193 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 DMC1Q14565 340 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF284Q2VY69 593 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ARSIQ5FYB1 569 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GLYATL1Q969I3 302 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 OR51B5Q9H339 312 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 SNPHO15079 494 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TGM5O43548 720 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TIMP2P16035 220 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 LIMS1P48059 325 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PRLHRP49683 370 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TXNDC15Q96J42 360 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5M11Q96RB7 305 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PCM1Q15154 2024 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 GADD45GO95257 159 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ALOX12P18054 663 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CA8P35219 290 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CDC42P60953 191 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TBPL1P62380 186 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 MED22Q15528 200 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 ADIPOR2Q86V24 386 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 WDR48Q8TAF3 677 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 CDCA4Q9BXL8 241 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R9Q9NYW1 312 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 PEX16Q9Y5Y5 336 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-221ENST00000511747 MED26O95402 600 aa25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms