RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SVOPLQ8N434 492 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 NATD1Q8N6N6 113 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX19Q92543 992 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MSANTD3Q96H12 275 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS50Q96JG6 964 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR92Q96MX6 357 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 QRFPRQ96P65 431 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MYOCQ99972 504 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A20Q9NP91 592 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM184CQ9NVA4 438 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D29Q9UFV1 150 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 EBF1Q9UH73 591 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CA5BQ9Y2D0 317 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 R4GN57 208 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIOO75962 3097 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DOCK9Q9BZ29 2069 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FEZF1A0PJY2 475 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KRBA1A5PL33 1030 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NCN8 305 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC72A6NJI9 287 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM64CA6NLI5 447 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RTCAO00442 366 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TOR1BO14657 336 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DPM1O60762 260 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 EML2O95834 649 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CST1P01037 141 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ALPLP05186 524 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DCNP07585 359 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ACADMP11310 421 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF23P17027 643 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DDCP20711 480 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPGP40121 348 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FRKP42685 505 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYBA2P53672 197 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ARSFP54793 590 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 YPEL5P62699 121 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 HYAL2Q12891 473 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ADPRMQ3LIE5 342 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 LIN52Q52LA3 116 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF425Q6IV72 752 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 IYDQ6PHW0 289 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ENPP7Q6UWV6 458 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF852Q6ZMS4 543 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MMP21Q8N119 569 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 NAGSQ8N159 534 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DHRSXQ8N5I4 330 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PJA1Q8NG27 643 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM3CQ92520 227 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 NCLNQ969V3 563 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RGMAQ96B86 450 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 RDH12Q96NR8 316 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TBC1D17Q9HA65 648 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SPHK1Q9NYA1 384 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TAS2R7Q9NYW3 318 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TAAR2Q9P1P5 351 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 SPASTQ9UBP0 616 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 KLF15Q9UIH9 416 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 MOSPD1Q9UJG1 213 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 CROCCQ5TZA2 2017 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0A6YYD5 115 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GTW7 788 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PRB8 838 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-209ENST00000504450 LRIT2A6NDA9 550 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms