RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 DVL2O14641 736 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO45P0C2W1 286 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 GGT5P36269 586 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 HYAL2Q12891 473 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 SPINK14Q6IE38 97 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ZFATQ9P243 1243 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 TAC3Q9UHF0 121 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 CES2O00748 559 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 CEP104O60308 925 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 CTNSO60931 367 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 TNNT1P13805 278 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 CTSSP25774 331 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 SNTA1Q13424 505 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 LAPTM5Q13571 262 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 NSDHLQ15738 373 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 TBCCQ15814 346 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 NRTNQ99748 197 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 IFNKQ9P0W0 207 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-210ENST00000503258 LINC01387J3KSC0 135 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CHST10O43529 356 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SNX4O95219 450 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 HRGP04196 525 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PRSS56P0CW18 603 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PSMB5P28074 263 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MAN2A2P49641 1150 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 RGS4P49798 205 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 DCAF7P61962 342 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SPA17Q15506 151 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 KAZNQ674X7 775 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CD200R1Q8TD46 325 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 NAT9Q9BTE0 207 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 DMRT3Q9NQL9 472 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MYOTQ9UBF9 498 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TPOP07202 933 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 NPPBP16860 134 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TYK2P29597 1187 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MARCKSL1P49006 195 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TGM3Q08188 693 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 KCNJ11Q14654 390 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SLC10A1Q14973 349 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PRELID2Q8N945 189 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SMC6Q96SB8 1091 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CHP1Q99653 195 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 GOLPH3Q9H4A6 298 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 GRID2IPA4D2P6 1211 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 H7BY64 318 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 RCBTB2O95199 551 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SLC16A8O95907 504 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 C1QAP02745 245 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TBPL1P62380 186 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 NTRK2Q16620 822 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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