RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	IP6K3	Q96PC2	410 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	ZIM3	Q96PE6	472 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	MS4A8	Q9BY19	250 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	OR51B5	Q9H339	312 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	COPG2	Q9UBF2	871 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		9.28	□□□□□ -0.92
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	B3GALT2	O43825	422 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ERLIN1	O75477	346 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	OR4F21	O95013	312 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	OTC	P00480	354 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CPA3	P15088	417 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ACPP	P15309	386 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CREB1	P16220	341 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	IMPDH1	P20839	514 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CERS1	P27544	350 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	SSR2	P43308	183 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	RAP1GDS1	P52306	607 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	PHEX	P78562	749 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TGM3	Q08188	693 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	RUNX2	Q13950	521 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	E2F2	Q14209	437 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC153	Q494R4	210 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	DCAF10	Q5QP82	559 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CHSY3	Q70JA7	882 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CA13	Q8N1Q1	262 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	AMER2	Q8N7J2	671 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	BANP	Q8N9N5	519 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TSLP	Q969D9	159 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	REPS1	Q96D71	796 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	WBP1	Q96G27	269 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	APOPT1	Q96IL0	206 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	QRFPR	Q96P65	431 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	NTMT1	Q9BV86	223 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		9.27	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	BSN	Q9UPA5	3926 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024		A0A088AWK7	358 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024		H0YIV9	168 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024		K7EM74	188 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	UGDH	O60701	494 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	FH	P07954	510 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ITGA3	P26006	1051 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	SERPINB1	P30740	379 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	PIK3CB	P42338	1070 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	NAGLU	P54802	743 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	MTTP	P55157	894 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	BTG2	P78543	158 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	NFATC3	Q12968	1075 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	IFT88	Q13099	833 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	CFAP157	Q5JU67	520 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	COLEC12	Q5KU26	742 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	FRG2	Q64ET8	278 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	IQCK	Q8N0W5	287 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CALD1-223	ENST00000496024	GALNT16	Q8N428	558 aa		9.26	□□□□□ -0.93

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