RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 FOXK1P85037 733 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 Q0VFX4 171 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 HYAL2Q12891 473 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 GTF2H2Q13888 395 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC29A2Q14542 456 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM35AQ53FP2 167 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SFT2D3Q587I9 215 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 LIPJQ5W064 366 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SIRT6Q8N6T7 355 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SUN3Q8TAQ9 357 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP4R1Q8TF05 950 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ISL2Q96A47 359 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PHF21BQ96EK2 531 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SMIM10Q96HG1 83 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SERINC2Q96SA4 455 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ABI3Q9P2A4 366 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.26■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 OR2W5A6NFC9 320 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 A8MUI8 341 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MTHFD2P13995 350 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TAC1P20366 129 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 RAP1GDS1P52306 607 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TAS2R50P59544 299 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 RHAGQ02094 409 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TLR1Q15399 786 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 AP5B1Q2VPB7 878 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TECRLQ5HYJ1 363 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 GRHL2Q6ISB3 625 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CA13Q8N1Q1 262 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CMTM7Q96FZ5 175 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 IPPKQ9H8X2 491 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 KCNK13Q9HB14 408 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PRDM9Q9NQV7 894 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 LANCL2Q9NS86 450 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PLAAQ9Y263 795 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ASB1Q9Y576 335 aa25.25■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM153BP0C7A2 387 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MAGEA12P43365 314 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM153CQ494X1 144 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PLAG1Q6DJT9 500 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ADGRD1Q6QNK2 874 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 QSOX2Q6ZRP7 698 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR78Q96P69 363 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 F2RL3Q96RI0 385 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TBCDQ9BTW9 1192 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 XPR1Q9UBH6 696 aa25.24■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 UGDHO60701 494 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CCNG1P51959 295 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC13A2Q13183 592 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 Q6ZS92 163 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 LCA5Q86VQ0 697 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 LAS2Q8IYD9 372 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 OR7G3Q8NG95 312 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 M1APQ8TC57 530 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 IMMP1LQ96LU5 166 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF358Q9NW07 568 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 STMN3Q9NZ72 180 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 FETUBQ9UGM5 382 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MMACHCQ9Y4U1 282 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PCSK5Q92824 1860 aa25.23■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 KLK8O60259 260 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TGFB1P01137 390 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ITGAMP11215 1152 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 EPORP19235 508 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CD22P20273 847 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 RAB38P57729 211 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF33BQ06732 778 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDH1Q08174 1060 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ABHD17CQ6PCB6 329 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 IGFL2Q6UWQ7 119 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TSLPQ969D9 159 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MIB2Q96AX9 1013 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.22■■□□□ 1.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa25.22■■□□□ 1.63
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