RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CIPCQ9C0C6 399 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 FPGTO14772 594 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 UGT2B17O75795 530 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF15O94989 841 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SOX14O95416 240 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CYP17A1P05093 508 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TACR1P25103 407 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DL3P43628 341 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GPNMBQ14956 572 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GPR19Q15760 415 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf22Q49AR2 442 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO43Q4G163 708 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 C22orf42Q6IC83 251 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SRRDQ9UH36 339 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 KDELR3O43731 214 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN11O75508 207 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT7P0C024 238 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SSTR2P30874 369 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 EVI2BP34910 448 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GZMKP49863 264 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GLRX5Q86SX6 157 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LGI4Q8N135 537 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA2Q9UM82 520 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NINQ8N4C6 2090 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 H7C4K7 107 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CSKP41240 450 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RING1Q06587 406 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ABHD18Q0P651 414 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MAB21L1Q13394 359 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MYLIPQ8WY64 445 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 COPS8Q99627 209 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MAGIXQ9H6Y5 334 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ASB8Q9H765 288 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 FNIP2Q9P278 1114 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 STX16O14662 325 aa15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ESR1P03372 595 aa15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RAB14P61106 215 aa15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CLN6Q9NWW5 311 aa15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GVM2 712 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 LEUTXA8MZ59 168 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ISM1B1AKI9 464 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 H3BNC9 293 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 FFAR2O15552 330 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 TOXO94900 526 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CRATP43155 626 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MAP2K3P46734 347 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 TM4SF4P48230 202 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42P60953 191 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRF1Q5T601 910 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ATG9BQ674R7 924 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 APCDD1Q8J025 514 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CD200R1Q8TD46 325 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN7O95471 211 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 PRAMEF1O95521 474 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 EPOP01588 193 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 COX7A2P14406 83 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 KIR3DL1P43629 444 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN5P54829 565 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RPA4Q13156 261 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 BTN1A1Q13410 526 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 RNF175Q8N4F7 328 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 EID2BQ96D98 161 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 FAM129BQ96TA1 746 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 BEX1Q9HBH7 125 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV6A0A075B6T7 132 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 TEX46H3BTG2 121 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-204ENST00000483092 KPNA5O15131 536 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms