RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	NDE1	Q9NXR1	346 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.13	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A088AWK7	358 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529		B2RBV5	119 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BMH7	237 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CFLAR	O15519	480 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF10	O60809	474 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	EED	O75530	441 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	MYF5	P13349	255 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CD1E	P15812	388 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CSF2RB	P32927	897 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	RAP1GDS1	P52306	607 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNK10	P57789	538 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	NCALD	P61601	193 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP4F2	P78329	520 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CCL7	P80098	99 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	DAB2	P98082	770 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC9A5	Q14940	896 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	MED25	Q71SY5	747 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	IFI44	Q8TCB0	444 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SPDL1	Q96EA4	605 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	EGLN2	Q96KS0	407 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC6	Q99741	560 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	EHD3	Q9NZN3	535 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP10	Q9P2G4	905 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB4	Q9Y574	426 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CACNA1A	O00555	2505 aa		12.12	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ERICH4	A6NGS2	130 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	GABRR3	A8MPY1	467 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	FBP2	O00757	339 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SCN2B	O60939	215 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPIND1	P05546	499 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	PGR	P06401	933 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT16	P08779	473 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ALOX12	P18054	663 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	GCGR	P47871	477 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	MTTP	P55157	894 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	E2F1	Q01094	437 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP4F3	Q08477	520 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	AMZ1	Q400G9	498 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	GK5	Q6ZS86	529 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	KCT2	Q8NC54	265 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8K5	Q8NH50	307 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	TSSK3	Q96PN8	268 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	REEP4	Q9H6H4	257 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	LYRM4	Q9HD34	91 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	GMEB1	Q9Y692	573 aa		12.11	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC154	A6NI56	674 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	C4orf47	A7E2U8	309 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	TM4SF5	O14894	197 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	GSC2	O15499	205 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	P2RX6	O15547	441 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	HCRTR1	O43613	425 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	SH3BP5	O60239	455 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TRAF4-208	ENST00000469529	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47

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