RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 FAM9CQ8IZT9 166 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 ACOT4Q8N9L9 421 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 TMEM45AQ9NWC5 275 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 TMEM150CB9EJG8 249 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 NR5A2O00482 541 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 TXNDC9O14530 226 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 SCELO95171 688 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 PCSK2P16519 638 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 ALOX12P18054 663 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 CERS1P27544 350 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 ASMTP46597 345 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 CPA2P48052 419 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 MAPK12P53778 367 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 DEFB134Q4QY38 66 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 TCTE1Q5JU00 501 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 ABHD13Q7L211 337 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 PRSS41Q7RTY9 318 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 CLMPQ9H6B4 373 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 MYNNQ9NPC7 610 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 SLC22A7Q9Y694 548 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 DMXL1Q9Y485 3027 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP10A1A4S6 786 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 FAM234BA2RU67 622 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 AKAP10O43572 662 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 MED26O95402 600 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 CAPN3P20807 821 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 PDX1P52945 283 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 TAS2R50P59544 299 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 PHF19Q5T6S3 580 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 TM4SF18Q96CE8 201 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ENAMQ9NRM1 1142 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 UNC5CO95185 931 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 IL1RNP18510 177 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 PRPS1L1P21108 318 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 CALB2P22676 271 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 C21orf58P58505 322 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 MAPRE2Q15555 327 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 FAM71E1Q6IPT2 247 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 PDSS2Q86YH6 399 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 OR1L3Q8NH93 324 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 C10orf90Q96M02 699 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 TUBB6Q9BUF5 446 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 FGF21Q9NSA1 209 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 TOR4AQ9NXH8 423 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 FITM1A5D6W6 292 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 AGRPO00253 132 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 PRMT3O60678 531 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 IL3P08700 152 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 MTTPP55157 894 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 MC1RQ01726 317 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 SLAMF1Q13291 335 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 UGT8Q16880 541 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 VPS26BQ4G0F5 336 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 CCDC157Q569K6 752 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 DTWD1Q8N5C7 304 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 VPS33AQ96AX1 596 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 SPDL1Q96EA4 605 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 SLC25A23Q9BV35 468 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 IRAK4Q9NWZ3 460 aa23■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 FBP2O00757 339 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 OR2B3O76000 313 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 DGKQP52824 942 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 KCNK10P57789 538 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 SLC9A5Q14940 896 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 SPANXN4Q5MJ08 99 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 MMP21Q8N119 569 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 TESCQ96BS2 214 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ZBTB18Q99592 522 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ASB4Q9Y574 426 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 HYKKA2RU49 373 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 ASPDHA6ND91 283 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-209ENST00000460297 DNAJB6O75190 326 aa22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms