RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	VMP1	Q96GC9	406 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PANX3	Q96QZ0	392 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TRIB1	Q96RU8	372 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PKP4	Q99569	1192 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	REG4	Q9BYZ8	158 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	MPDZ	O75970	2070 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	KPNA5	O15131	536 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SIAH2	O43255	324 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SERPIND1	P05546	499 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	CCL3	P10147	92 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ERG	P11308	486 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	FOXO1	Q12778	655 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC38	Q5VT99	294 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF480	Q8WV37	535 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	RASL10B	Q96S79	203 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	BEX2	Q9BXY8	128 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	JKAMP	Q9P055	326 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZFAT	Q9P243	1243 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	CUBN	O60494	3623 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		6.62	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	MROH6	A6NGR9	719 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF839	A8K0R7	811 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504		E7ENX8	843 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SPOP	O43791	374 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC16A8	O95907	504 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PPP2R1B	P30154	601 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	CPOX	P36551	454 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	KCNJ2	P63252	427 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PRAME	P78395	509 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TAP2	Q03519	686 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	FOXF2	Q12947	444 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	DUSP8	Q13202	625 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	BMPR2	Q13873	1038 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	HERC3	Q15034	1050 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF534	Q76KX8	674 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TIMP4	Q99727	224 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	RBSN	Q9H1K0	784 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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