RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC39Q96DD0 335 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM10Q96HG1 83 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CHST11Q9NPF2 352 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF835Q9Y2P0 537 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MTORP42345 2549 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SPG11Q96JI7 2443 aa9.64□□□□□ -0.87
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SH3BP4-206ENST00000446904 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP4-206ENST00000446904 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP4-206ENST00000446904 MYO1DO94832 1006 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR47O94967 919 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ABOP16442 354 aa9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP4-206ENST00000446904 HNMTP50135 292 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 BTN3A2P78410 334 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CDKL1Q00532 357 aa9.63□□□□□ -0.87
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SH3BP4-206ENST00000446904 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CREG2Q8IUH2 290 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GHDCQ8N2G8 530 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 AGAP11Q8TF27 550 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CCT6BQ92526 530 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD7Q92527 254 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FAR2Q96K12 515 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GPAMQ9HCL2 828 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MEMO1Q9Y316 297 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 OARD1Q9Y530 152 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNA1CQ13936 2221 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GTF3C1Q12789 2109 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf72A6NCS6 295 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 C19orf84I3L1E1 186 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FCHO1O14526 889 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GNAZP19086 355 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 AGAP20933 346 aa9.62□□□□□ -0.87
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SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PTGER4P35408 488 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC6A12P48065 614 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MEOX1P50221 254 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GNG11P61952 73 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 RUNX2Q13950 521 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DOLPP1Q86YN1 238 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS39Q96JC1 886 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 RHOJQ9H4E5 214 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SNX24Q9Y343 169 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 LRIT2A6NDA9 550 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 E7ESA3 106 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CDK2AP1O14519 115 aa9.61□□□□□ -0.87
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