RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 SLC35F4A4IF30 521 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00862A6NCI5 91 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PTHP01270 115 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MSL3P1P0C860 447 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 AGTR2P50052 363 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DAB2P98082 770 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 IL10RBQ08334 325 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 VITQ6UXI7 678 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF783Q6ZMS7 281 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 OR4M2Q8NGB6 313 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DERL2Q9GZP9 239 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MARK1Q9P0L2 795 aa16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MROH6A6NGR9 719 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KDELR3O43731 214 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 EPN2O95208 641 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 HSMCR30P0CW71 290 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CPN2P22792 545 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CSKP41240 450 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CRISP3P54108 245 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CDH18Q13634 790 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 C19orf48Q6RUI8 117 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KDELC1Q6UW63 502 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KRT73Q86Y46 540 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PLPP6Q8IY26 295 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TEX26Q8N6G2 289 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 LHFPL5Q8TAF8 219 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FIBINQ8TAL6 211 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 WDFY2Q96P53 400 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SP110Q9HB58 689 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 AMBNQ9NP70 447 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PLD2O14939 933 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CD160O95971 181 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CYP17A1P05093 508 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 LAMP2P13473 410 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CD70P32970 193 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ARF5P84085 180 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 LMAN2Q12907 356 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 APCDD1Q8J025 514 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 STX19Q8N4C7 294 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MYLIPQ8WY64 445 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 HSPB11Q9Y547 144 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KLK8O60259 260 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 STSP08842 583 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CHMP24386 653 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GZMMP51124 257 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 QPRTQ15274 297 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 NR6A1Q15406 480 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FAHD1Q6P587 224 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FGF14Q92915 247 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SPON2Q9BUD6 331 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 AUP1Q9Y679 476 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SEC14L5O43304 696 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 VPS26AO75436 327 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 VIPP01282 170 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TYRP14679 529 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 HLA-FP30511 346 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DHCR24Q15392 516 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PARM1Q6UWI2 310 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF382Q96SR6 550 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms