RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432547.7

TTR-202, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 2

Gene TTR, Length 745 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-202ENST00000432547 AVILO75366 819 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 NUDT3O95989 172 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 KRT14P02533 472 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 EBLN1P0CF75 366 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 FOLR1P15328 257 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 NR1D1P20393 614 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 MSH3P20585 1137 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 MGAT1P26572 445 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 AKT1P31749 480 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 FOXN2P32314 431 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 HADHAP40939 763 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 PTTG1IPP53801 180 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 PMS2P54278 862 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 DCAF7P61962 342 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 HSD11B2P80365 405 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 PDE1BQ01064 536 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ACY1Q03154 408 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ACVR1Q04771 509 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 FOXO1Q12778 655 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 KLRB1Q12918 225 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 GPS1Q13098 491 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 TUBB3Q13509 450 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 IL10RAQ13651 578 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 LAMB3Q13751 1172 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ERV3-1Q14264 604 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 SEMA3AQ14563 771 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 KCNAB1Q14722 419 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 BCL7AQ4VC05 210 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 SNX20Q7Z614 316 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 LINC00523Q86TU6 105 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 TMEM135Q86UB9 458 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 OOSP2Q86WS3 158 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CPOQ8IVL8 374 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 MPP5Q8N3R9 675 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CT55Q8WUE5 264 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CPT1BQ92523 772 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ZNF566Q969W8 418 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 LRRC45Q96CN5 670 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 RANBP9Q96S59 729 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 WWP1Q9H0M0 922 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ACTL8Q9H568 366 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 PDE7BQ9NP56 450 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 FGF21Q9NSA1 209 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 SYBUQ9NX95 663 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 AASSQ9UDR5 926 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 RARRES3Q9UL19 164 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 BTRCQ9Y297 605 aa6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTR-202ENST00000432547 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 HEATR9A2RTY3 570 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 TPSB2P20231 275 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 ITGALP20701 1170 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 ADRA1DP25100 572 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 CTSSP25774 331 aa6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TTR-202ENST00000432547 NDUFS1P28331 727 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms