RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416636.2

CLK2P1-201, Transcript of CDC like kinase 2, pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CLK2P1, Length 1,294 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P1-201ENST00000416636 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 CYP4X1Q8N118 509 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 TCAIMQ8N3R3 496 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 TTLQ8NG68 377 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 UBXN10Q96LJ8 280 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 RHBGQ9H310 441 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 EHD1Q9H4M9 534 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 NT5DC2Q9H857 520 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 KLHL1Q9NR64 748 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.65□□□□□ -0.54
CLK2P1-201ENST00000416636 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 A0A0G2JN53 185 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 A8MUA0 341 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CDK2AP1O14519 115 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CLEC3AO75596 197 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 SP1P08047 785 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 GSTA2P09210 222 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CD46P15529 392 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 STMN1P16949 149 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 GSTM2P28161 218 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 GMPRP36959 345 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 HSPA7P48741 367 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ATP6V0D1P61421 351 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 GPSM1Q86YR5 675 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 KRT78Q8N1N4 520 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 PDPRQ8NCN5 879 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 WDR34Q96EX3 536 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 FRMD6Q96NE9 622 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 QRFPRQ96P65 431 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 WWOXQ9NZC7 414 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 LRFN1Q9P244 771 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 MMACHCQ9Y4U1 282 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.64□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 DNAJC13O75165 2243 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 STK16O75716 305 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 FAM155BO75949 473 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 EPORP19235 508 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CD22P20273 847 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CA7P43166 264 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 PLTPP55058 493 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 MLF1P58340 268 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 RAB10P61026 200 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 DLG1Q12959 904 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 DOC2AQ14183 400 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 E2F2Q14209 437 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TRADDQ15628 312 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 SLC25A25Q6KCM7 469 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 SLC34A3Q8N130 599 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 HORMAD2Q8N7B1 307 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 OR2L5Q8NG80 312 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CCT6BQ92526 530 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 KIAA1191Q96A73 305 aa11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLK2P1-201ENST00000416636 CCDC120Q96HB5 630 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms