RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 FAR2Q96K12 515 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 FRMD6Q96NE9 622 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RBBP8Q99708 897 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ERP44Q9BS26 406 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 WHRNQ9P202 907 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CLGNO14967 610 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PRAMEF4O60810 478 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SP1P08047 785 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PPP2R1BP30154 601 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PLA2G16P53816 162 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 C3AR1Q16581 482 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GPSM1Q86YR5 675 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 LGI4Q8N135 537 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 KRT78Q8N1N4 520 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MAGED4Q96JG8 741 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GPR137Q96N19 417 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GPR22Q99680 433 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CPNE1Q99829 537 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CD274Q9NZQ7 290 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TINAGQ9UJW2 476 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ASPDHA6ND91 283 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 LRIT2A6NDA9 550 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SLC19A2O60779 497 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SLC25A12O75746 678 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 FAM155BO75949 473 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MYO1DO94832 1006 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 STMN1P16949 149 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CERS1P27544 350 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GP5P40197 560 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RAB38P57729 211 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MLF1P58340 268 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GPX6P59796 221 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 HSF1Q00613 529 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SLMAPQ14BN4 828 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 XKR6Q5GH73 641 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CCDC25Q86WR0 208 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TTLQ8NG68 377 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MARVELD3Q96A59 401 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CSF3RQ99062 836 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RNF112Q9ULX5 631 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ASB1Q9Y576 335 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 FAM159BA6NKW6 160 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 B3GALT2O43825 422 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CLEC3AO75596 197 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CD22P20273 847 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CYB561P49447 251 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 PLTPP55058 493 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CASP6P55212 293 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SLC13A2Q13183 592 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 CBLBQ13191 982 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.092e-36■■■■■ 41.6
ACTB-202ENST00000414620 PDK4Q16654 411 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-202ENST00000414620 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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