RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SQLEQ14534 574 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PTPRRQ15256 657 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MAPRE2Q15555 327 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TGFBIQ15582 683 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PFKFB4Q16877 469 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KIF19Q2TAC6 998 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 UNC50Q53HI1 259 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EOGTQ5NDL2 527 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 BROXQ5VW32 411 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GPSM1Q86YR5 675 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AGAP11Q8TF27 550 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GLYATL1Q969I3 302 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 FAM136AQ96C01 138 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NUS1Q96E22 293 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PHF21BQ96EK2 531 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C19orf60Q96EN9 201 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NSL1Q96IY1 281 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 COQ10AQ96MF6 247 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ACOX2Q99424 681 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NUF2Q9BZD4 464 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 C1orf21Q9H246 121 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 NDE1Q9NXR1 346 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SUN2Q9UH99 717 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PCTPQ9UKL6 214 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 A0A0U1RQS6 177 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 E9PBE3 544 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 E2F3O00716 465 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SDHDO14521 159 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AZIN1O14977 448 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 FFAR2O15552 330 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KLHL41O60662 606 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TOX4O94842 621 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ESRRBO95718 433 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CHEK2O96017 543 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 FGF4P08620 206 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 T-ENOLP0DO92 83 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MSH3P20585 1137 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TEAD1P28347 426 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 GRK6P43250 576 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TNFRSF4P43489 277 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PSMD8P48556 350 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 HNMTP50135 292 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AP1S2P56377 157 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KCNJ2P63252 427 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 B4GALNT1Q00973 533 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 RIPK1Q13546 671 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 ACOX1Q15067 660 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 BCL7AQ4VC05 210 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 SYTL3Q4VX76 610 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MRGPREQ86SM8 312 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KIF18BQ86Y91 864 aa6.31□□□□□ -1.4
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CCL20-202ENST00000409189 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 PELI3Q8N2H9 469 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TEX9Q8N6V9 391 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 AGR3Q8TD06 166 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MAPK15Q8TD08 544 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-202ENST00000409189 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.31□□□□□ -1.4
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