RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 ZNF33AQ06730 810 aa8□□□□□ -1.13
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SNX13-201ENST00000409076 GCNT6Q5T4J0 391 aa8□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 USP51Q70EK9 711 aa8□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 GPR149Q86SP6 731 aa8□□□□□ -1.13
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SNX13-201ENST00000409076 TEX26Q8N6G2 289 aa8□□□□□ -1.13
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SNX13-201ENST00000409076 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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SNX13-201ENST00000409076 PKMYT1Q99640 499 aa7.99□□□□□ -1.13
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SNX13-201ENST00000409076 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 H7BY64 318 aa7.99□□□□□ -1.13
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SNX13-201ENST00000409076 ANKRD28O15084 1053 aa7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 SGTAO43765 313 aa7.99□□□□□ -1.13
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SNX13-201ENST00000409076 AMD1P17707 334 aa7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 SLC35A2P78381 396 aa7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 CAMK1Q14012 370 aa7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 DUSP7Q16829 419 aa7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SNX13-201ENST00000409076 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
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