RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 STARD3Q14849 445 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 GRIN2CQ14957 1233 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF77Q15935 545 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 FAM71E1Q6IPT2 247 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 OR9A1PQ8NGU1 263 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 OR52J3Q8NH60 311 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 WDR48Q8TAF3 677 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PROX1Q92786 737 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 GULP1Q9UBP9 304 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 AIREO43918 545 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SLC19A1P41440 591 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CDK6Q00534 326 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MC1RQ01726 317 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SYT16Q17RD7 645 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CRB2Q5IJ48 1285 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF605Q86T29 641 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 DENND6BQ8NEG7 585 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MCFD2Q8NI22 146 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 DTD2Q96FN9 168 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 RNF208Q9H0X6 261 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 OR51B5Q9H339 312 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 DSN1Q9H410 356 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ITM2CQ9NQX7 267 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 RLIMQ9NVW2 624 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R9Q9NYW1 312 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZBBXA8MT70 800 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 M0R082 166 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TIGD6Q17RP2 521 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC103Q8IW40 242 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 METTL4Q8N3J2 472 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SLC5A11Q8WWX8 675 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF556Q9HAH1 456 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ITM2BQ9Y287 266 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SAP18O00422 153 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 KRT75O95678 551 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PTPN2P17706 415 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CTSKP43235 329 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 VASPP50552 380 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R50P59544 299 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 NXPE4Q6UWF7 544 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 COQ10AQ96MF6 247 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ACSL6Q9UKU0 697 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 EFCAB14O75071 495 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TGM1P22735 817 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TGFBR1P36897 503 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 IDH2P48735 452 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MPEG1Q2M385 716 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS36Q5K4E3 855 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 RNF130Q86XS8 419 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 OTUB2Q96DC9 234 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MMP27Q9H306 513 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF226Q9NYT6 803 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ANGPT4Q9Y264 503 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PRAMEF25A6NGN4 478 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 LILRB5O75023 590 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 COQ9O75208 318 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 IRS1P35568 1242 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PIK3CBP42338 1070 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SLC30A8Q8IWU4 369 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2E3Q969T4 207 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 RAD9AQ99638 391 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PIP5K1AQ99755 562 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PSD2Q9BQI7 771 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 KLHL18O94889 574 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 ARAFP10398 606 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 GABRB1P18505 474 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 WEE1P30291 646 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 XCR1P46094 333 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 PPP5CP53041 499 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 SLC5A12Q1EHB4 618 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO43Q4G163 708 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 UNC5DQ6UXZ4 953 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 SNX29P2Q8IUI4 249 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 ARMC8Q8IUR7 673 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 DACH2Q96NX9 599 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 COL21A1Q96P44 957 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 ENOPH1Q9UHY7 261 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 PTPRSQ13332 1948 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PRB8 838 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXD13-201ENST00000392539 TAP2Q03519 686 aa25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms