RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CHSY3Q70JA7 882 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 81.8
NSL1-201ENST00000366976 SNX31Q8N9S9 440 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PEX11GQ96HA9 241 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 QRFPRQ96P65 431 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 KCNC2Q96PR1 638 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SERINC2Q96SA4 455 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PAFAH2Q99487 392 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.63□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CLDN4O14493 209 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 STX16O14662 325 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 FFAR3O14843 346 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 GPR42O15529 346 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PRAMEF4O60810 478 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SUPT3HO75486 399 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 JRKO75564 520 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SCELO95171 688 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 STATHP02808 62 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 EFNA3P52797 238 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 IGFBP7Q16270 282 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MED27Q6P2C8 311 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 REPS1Q96D71 796 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 KLHL31Q9H511 634 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PPCSQ9HAB8 311 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 LYRM4Q9HD34 91 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PLAAQ9Y263 795 aa14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 H0YIV9 168 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 UBXN8O00124 270 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 B3GALT2O43825 422 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CD22P20273 847 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TNFSF10P50591 281 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MTTPP55157 894 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 RAB8AP61006 207 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 BTN3A2P78410 334 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 BMPR2Q13873 1038 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CUZD1Q86UP6 607 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CA13Q8N1Q1 262 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 OR7G3Q8NG95 312 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 AICDAQ9GZX7 198 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 STMN3Q9NZ72 180 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 NFU1Q9UMS0 254 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.61□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 RELNP78509 3460 aa14.6□□□□□ -0.07
NSL1-201ENST00000366976 MASP2O00187 686 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms