RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 NPTX1Q15818 432 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 WSCD2Q2TBF2 565 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 24.5
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SPNS1-204ENST00000352260 OR56A3Q8NH54 315 aa17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 TRIM63Q969Q1 353 aa17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 NFE2L1Q14494 772 aa17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 OR4K3Q96R72 315 aa17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa17.88■□□□□ 0.45
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SPNS1-204ENST00000352260 DOC2AQ14183 400 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 AGERQ15109 404 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 SPESP1Q6UW49 350 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC103Q8IW40 242 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 IL17RDQ8NFM7 739 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF480Q8WV37 535 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.86■□□□□ 0.45
SPNS1-204ENST00000352260 APOL4Q9BPW4 351 aa17.86■□□□□ 0.45
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