RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 GPAMQ9HCL2 828 aa14.83□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.83□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.83□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SNX24Q9Y343 169 aa14.83□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 URADA6NGE7 173 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ENO4A6NNW6 628 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 MYO1DO94832 1006 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SERPINA6P08185 405 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF24P17028 368 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 RFC3P40938 356 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 HNMTP50135 292 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CASP6P55212 293 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 MLF1P58340 268 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 BTN3A2P78410 334 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CDKL1Q00532 357 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ART3Q13508 389 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CDSNQ15517 529 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 RPTNQ6XPR3 784 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 FAM47BQ8NA70 645 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 AKAP9Q99996 3911 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.82□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 POLQO75417 2590 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC188H7C350 402 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 GNAZP19086 355 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 HTR1EP28566 365 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 GMPRP36959 345 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TGFBIQ15582 683 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 MTFR2Q6P444 385 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 EXT2Q93063 718 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CSF3RQ99062 836 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 DPH5Q9H2P9 285 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 WWOXQ9NZC7 414 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 PRAMEF4O60810 478 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ABOP16442 354 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CERS1P27544 350 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SSTR1P30872 391 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 PTGER1P34995 402 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CYB561P49447 251 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SLC12A2P55011 1212 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 RUNX2Q13950 521 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 OR4D1Q15615 310 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ANKRD7Q92527 254 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ESAMQ96AP7 390 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 FAR2Q96K12 515 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 DERL2Q9GZP9 239 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.8□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 LRIT2A6NDA9 550 aa14.79□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 FCHO1O14526 889 aa14.79□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TAPBPO15533 448 aa14.79□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 MLYCDO95822 493 aa14.79□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC166P0CW27 439 aa14.79□□□□□ -0.04
SYCE1-202ENST00000343131 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms