RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CREBBPQ92793 2442 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 LRIT2A6NDA9 550 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAD51CO43502 376 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 B3GALT2O43825 422 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 STK16O75716 305 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 B3GALT4O96024 378 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CD1DP15813 335 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 MAOAP21397 527 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 COL8A1P27658 744 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 GDF5P43026 501 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CA7P43166 264 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CYB561P49447 251 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 HSD17B7P56937 341 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAB10P61026 200 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 BTN3A2P78410 334 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 BTG2P78543 158 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 NAB1Q13506 487 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 LAPTM5Q13571 262 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 GRTP1Q5TC63 336 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF787Q6DD87 383 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 RPTNQ6XPR3 784 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 PDPRQ8NCN5 879 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 OR2L5Q8NG80 312 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CCT6BQ92526 530 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 RHBGQ9H310 441 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 LRFN1Q9P244 771 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ENTPD4Q9Y227 616 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CTAGE15A4D2H0 777 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 FANCGO15287 622 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 DNAJB6O75190 326 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC25A12O75746 678 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 NEURL1O76050 574 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SP1P08047 785 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CASQ1P31415 396 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 STX2P32856 288 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAB38P57729 211 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 MLF1P58340 268 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 PDK4Q16654 411 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SPINK14Q6IE38 97 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC25A25Q6KCM7 469 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 AMER2Q8N7J2 671 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 KIAA1191Q96A73 305 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 WDR34Q96EX3 536 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 MAGED4Q96JG8 741 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 GPR137Q96N19 417 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SERINC2Q96SA4 455 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 RUBCNLQ9H714 662 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLHL1Q9NR64 748 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 GRHL1Q9NZI5 618 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CD274Q9NZQ7 290 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TAPBPO15533 448 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC19A2O60779 497 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 CLCN2P51788 898 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 PMP22Q01453 160 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 ART3Q13508 389 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 TBCCQ15814 346 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 XKR6Q5GH73 641 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1-201ENST00000303731 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms