RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299335.7

COX11-201, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX11, Length 2,497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11-201ENST00000299335 OLR1P78380 273 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 PCDH1Q08174 1060 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 DMC1Q14565 340 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 SYTL3Q4VX76 610 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 IER5LQ5T953 404 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 NLRP8Q86W28 1048 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 RNF130Q86XS8 419 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 MGLLQ99685 303 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 RHCGQ9UBD6 479 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.9□□□□□ -0.02
COX11-201ENST00000299335 PLK4O00444 970 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CTDSP2O14595 271 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ASNA1O43681 348 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ITGA2P17301 1181 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CCL23P55773 120 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CDK6Q00534 326 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 MED27Q6P2C8 311 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SPATC1Q76KD6 591 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ATCAYQ86WG3 371 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 PIP5K1AQ99755 562 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 EHD3Q9NZN3 535 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 A8MVJ9 347 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SSX4O60224 188 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 GASTP01350 101 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CATP04040 527 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CTSAP10619 480 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 NR4A2P43354 598 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 HMGA2P52926 109 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SLC7A9P82251 487 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 RBBP4Q09028 425 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 EHD1Q9H4M9 534 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 MKLN1Q9UL63 735 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.89□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 LEFTY2O00292 366 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ARHGAP33O14559 1287 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 DYRK3O43781 588 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 GADD45GO95257 159 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 TGFB1P01137 390 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 FURINP09958 794 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CBLP22681 906 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CHMP24386 653 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CASP3P42574 277 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CDC42P60953 191 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SP3Q02447 781 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CCDC80Q76M96 950 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CCDC190Q86UF4 302 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 TMEM169Q96HH4 297 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SRRDQ9UH36 339 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 PSMD11O00231 422 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 GRM6O15303 877 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 KLHL18O94889 574 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CCNB2O95067 398 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 RECKO95980 971 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ZNF30P17039 623 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 CNR2P34972 360 aa14.88□□□□□ -0.03
COX11-201ENST00000299335 ETV6P41212 452 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms