RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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SF3B4-201ENST00000271628 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SF3B4-201ENST00000271628 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SF3B4-201ENST00000271628 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SF3B4-201ENST00000271628 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.61□□□□□ -0.07
SF3B4-201ENST00000271628 PYURFQ96I23 114 aa14.61□□□□□ -0.07
SF3B4-201ENST00000271628 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SF3B4-201ENST00000271628 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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