RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OCEL1Q9H607 264 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DKK3Q9UBP4 350 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GSAPA4D1B5 854 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 URADA6NGE7 173 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 B4GALT3O60512 393 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PREPP48147 710 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TBPL1P62380 186 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PRR5P85299 388 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RGS1Q08116 209 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZNB5 142 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PIGXQ8TBF5 258 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM110BQ8TC76 370 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FEVQ99581 238 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMEM245Q9H330 911 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GABRR3A8MPY1 467 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CENPXA8MT69 81 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GFYI3L273 518 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TEX28O15482 410 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMCC2O75069 709 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 UPK1BO75841 260 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ADH5P11766 374 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CTNNB1P35222 781 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PRLHRP49683 370 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PYDC2Q56P42 97 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LUZP2Q86TE4 346 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR7G3Q8NG95 312 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 UFD1Q92890 307 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SCAMP4Q969E2 229 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 A0A0U1RQS6 177 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GPR39O43194 453 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZW10O43264 779 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLCO2B1O94956 709 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 VIPP01282 170 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 POU2F1P14859 743 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TPTEP56180 551 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RPA4Q13156 261 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DDI2Q5TDH0 399 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LCTLQ6UWM7 567 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 USP30Q70CQ3 517 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC5A8Q8N695 610 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 THSD1Q9NS62 852 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PIPSLA2A3N6 862 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KRBA1A5PL33 1030 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MMP20O60882 483 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AGR2O95994 175 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TCF3P15923 654 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PIGAP37287 484 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CDKN2CP42773 168 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MAGEA2P43356 314 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SMSP52788 366 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PTSQ03393 145 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MBTPS1Q14703 1052 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 UGT8Q16880 541 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NAGSQ8N159 534 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TP53INP1Q96A56 240 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR51B5Q9H339 312 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DUSP21Q9H596 190 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms