RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258499.7

USP44-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP44, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-201ENST00000258499 SSR2P43308 183 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 XKP51811 444 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 DSTNP60981 165 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TBPL1P62380 186 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CD83Q01151 205 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SPIN4Q56A73 249 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 COX20Q5RI15 118 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 LIPJQ5W064 366 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 C17orf64Q86WR6 236 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 KRT78Q8N1N4 520 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PJA1Q8NG27 643 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 GGHQ92820 318 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 KAT2AQ92830 837 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 NEIL2Q969S2 332 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TESCQ96BS2 214 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 RNF208Q9H0X6 261 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 REEP4Q9H6H4 257 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SIAEQ9HAT2 523 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 NEK6Q9HC98 313 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.56□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 NINQ8N4C6 2090 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 FABP12A6NFH5 140 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 AGAP5A6NIR3 686 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 LEFTY2O00292 366 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CCRL2O00421 344 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 AREL1O15033 823 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 F11P03951 625 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 IL3P08700 152 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HLA-EP13747 358 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HOXC8P31273 242 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ITGA1P56199 1179 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SELENOWP63302 87 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PTSQ03393 145 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 GAB1Q13480 694 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 C5orf22Q49AR2 442 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TPGS2Q68CL5 300 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PLET1Q6UQ28 207 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 OXR1Q8N573 874 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TIFAQ96CG3 184 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 OR5M11Q96RB7 305 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CITED4Q96RK1 184 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TMEM245Q9H330 911 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 DUSP21Q9H596 190 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 RDH14Q9HBH5 336 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SERHLQ9NQF3 203 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 KLHL1Q9NR64 748 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SLC35F4A4IF30 521 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 QSOX1O00391 747 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TEX28O15482 410 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 AOC2O75106 756 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CD160O95971 181 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TYRP14679 529 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 S100A1P23297 94 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HLA-FP30511 346 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TIE1P35590 1138 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 GGT2P36268 569 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 RGS6P49758 472 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CXCR4P61073 352 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 FBXO43Q4G163 708 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.55□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms